疾患バイオマーカーとしてのマイクロRNAと診断応用

MicroRNA as Disease Biomarkers and Its Applications for Medical Diagnosis

【第Ⅰ編　miRNAと疾病】

<消化器系>

第1章　歯周病とmiRNA

第2章　口腔がん
1　背景
2　危険因子とmiRNA
3　発がんとmiRNA
4　がん促進型miRNA(Onco-miR)
5　がん抑制型miRNA(Suppressor-miR)
6　腫瘍組織中でのmiRNA
7　唾液中でのmiRNA
8　血漿中でのmiRNA
9　血清中でのmiRNA
10　全血中でのmiRNA
11　局所再発とmiRNA
12　予後とmiRNA
13　治療抵抗性とmiRNA
14　バイオマーカーとしてのmiRNA
15　おわりに

第3章　頭頸部扁平上皮癌・マイクロRNA発現プロファイルに基づく,癌抑制型マイクロRNAの探索
1　頭頸部癌について
2　頭頸部扁平上皮癌・マイクロRNA発現プロファイル
3　頭頸部扁平上皮癌・部位型マイクロRNA発現プロファイル
4　頭頸部扁平上皮癌における癌抑制型マイクロRNAの探索
5　新規癌抑制型マイクロRNA(パッセンジャー鎖の同定)
6　おわりに

第4章　食道がん
1　食道がんにおけるmiRNAの異常発現
2　組織
　2.1　食道扁平上皮癌
　2.2　食道腺癌
3　血液
　3.1　食道扁平上皮癌
　3.2　食道腺癌
4　尿・唾液

第5章　大腸がん
1　早期発見のためのバイオマーカー
2　リンパ節転移予測のためのバイオマーカー
3　遠隔転移・長期予後・再発のためのバイオマーカー
4　マイクロRNAを臨床応用する際に考慮すべき事項

第6章　慢性肝疾患におけるmiRNA発現の意義
1　肝臓におけるmiRNAの役割
2　肝疾患に関係する代表的なmiRNAの疾患における役割
　2.1　miR-122
　2.2　miR-194/192
　2.3　miR-223
　2.4　miR-29
　2.5　miR-21
3　循環血中のmiRNAにおける肝疾患診断
4　miRNA/exosomeを用いた核酸創薬の可能性

第7章　膵臓がん・胆道がん
1　膵臓がん・胆道がんの概要
2　膵臓がん・胆道がんの腫瘍マーカー
3　血中マイクロRNAを用いたがん検出検査
4　血中マイクロRNAを用いた膵臓がん・胆道がん診断の現状
5　血清マイクロRNA検査による膵臓がん・胆道がん診断開発への取り組み

<循環器系・生活習慣病>

第8章　不整脈
1　はじめに
2　不整脈基質
3　心房細動
4　心室性不整脈
5　マイクロRNAを不整脈のバイオマーカーとして用いる際の留意点
6　不整脈のリスク評価におけるマイクロRNAの位置づけ
7　結語

第9章　メタボリックシンドローム
1　はじめに
2　肥満とmiRNA
3　脂質異常症とmiRNA
4　高血圧とmiRNA
5　IRとmiRNA
6　おわりに

<呼吸器系>

第10章　肺がん
1　はじめに
2　肺癌におけるmiRNA発現異常
　2.1　TS miRNA
　2.2　Onco-miRNA
　2.3　肺癌の予後に関わるmiRNA
　2.4　肺癌患者の血清およびエクソソームmiRNA
　2.5　肺癌の薬剤耐性および治療標的miRNA
3　miRNAを用いた肺癌治療
4　今後の展望

第11章　気管支喘息
1　はじめに
2　各種疾患とmiRNA
3　喘息バイオマーカーとしてのmiRNAの可能性
4　気道炎症の指標としての喀痰中miRNAの可能性
5　喘息病態形成因子としてのmiRNAsの役割およびそのバイオマーカーとしての可能性
6　miRNAの喘息治療への応用
7　おわりに

<生殖器・泌尿器系>

第12章　腎疾患とmicroRNA
1　はじめに
2　腎線維化を修飾するmicroRNA
3　糖尿病性腎症を修飾するmicroRNA
4　急性腎障害を修飾するmicroRNA
5　おわりに

第13章　microRNAと膀胱がん
1　概要
2　はじめに
3　膀胱がんにおけるリキッドバイオプシー
4　膀胱がんにおけるmiRNAの発現異常
5　膀胱がんの診断と予後におけるエクソソームのmiRNA
6　おわりに

第14章　前立腺がんに対するmiRNA診断薬の開発の現状
1　はじめに
2　miRNAによる悪性化形質制御
3　核酸医薬の開発
4　分泌型miRNAによる機能
5　バイオマーカーとしての分泌型miRNA
6　おわりに

第15章　卵巣がん臨床におけるマイクロRNAバイオマーカー実現への期待
1　卵巣がん検診?
2　がん診療バイオマーカー
　2.1　卵巣がん早期診断を目指した臨床試験
　2.2　遺伝子検査としての体外診断用医薬品の保険承認
3　バイオマーカーとしてのマイクロRNA
　3.1　早期診断として
　3.2　予後予測として
　3.3　治療薬奏効率予測として
4　課題と今後の展望

第16章　子宮内膜症の病態形成におけるマイクロRNAの役割
1　はじめに
2　子宮内膜症におけるマイクロRNAの発現異常
3　子宮内膜症において発現が減少しているマイクロRNAとその意義
4　子宮内膜症において発現が増加しているマイクロRNAとその意義
5　マイクロRNAを標的とする薬剤
6　バイオマーカーとしてのマイクロRNA
7　おわりに

<内分泌器系>

第17章　乳がん
1　乳がんにおけるマイクロRNA
2　マイクロRNAの乳がん診断への応用
3　マイクロRNAの乳がん治療への応用
4　展望

第18章　甲状腺疾患におけるマイクロRNAと臨床応用
1　序論
2　MicroRNAと生体試料
3　甲状腺がんとmicroRNA
　3.1　腫瘍組織におけるmicroRNA解析
　3.2　FNABにおけるmicroRNA解析
　3.3　血液におけるmicroRNA解析
4　自己免疫性甲状腺疾患とmicroRNA
5　まとめ

第19章　副腎疾患とマイクロRNA
1　はじめに
2　副腎ホルモン産生腫瘤とマイクロRNA
　2.1　アルドステロン産生腫瘍
　2.2　コルチゾール
　2.3　アドレナリン
3　副腎悪性疾患とマイクロRNA
　3.1　副腎皮質癌
　3.2　悪性褐色細胞腫
4　バイオマーカーとしての血中マイクロRNA
5　おわりに

<免疫・アレルギー系>

第20章　皮膚疾患
1　乾癬
2　アトピー性皮膚炎
3　薬疹/中毒疹
4　全身強皮症
5　多発筋炎/皮膚筋炎
6　悪性黒色腫
7　有棘細胞癌

第21章　マイクロRNAと炎症性腸疾患
1　はじめに
2　自然免疫制御におけるmiRNAの役割
3　獲得免疫制御におけるmiRNAの役割
4　IBDにおけるmiRNA
5　miRNAの治療応用
6　最後に

<神経・運動器系>

第22章　miRNAと認知症
1　はじめに
2　認知症
3　血液バイオマーカーの探索とレトロスペクティブな発症予測モデルの開発
4　効果的なmiRNAと遺伝子機能アノテーション
5　AD発症・移行を予測するプロスペクティブな予測診断システムの開発
6　データベース構築
7　おわりに

第23章　miRNAと骨代謝
1　はじめに
2　In vivoにおけるmiRNAの骨代謝制御
3　骨粗鬆症
4　転移性骨腫瘍
5　骨折/再生
6　おわりに

第24章　miRNAと筋分化,筋再生,筋萎縮
1　はじめに
2　筋肉に関係する筋肉特異的miRNAと筋肉非特異的miRNA
3　細胞外miRNA
4　老齢の血中で減少する筋分化誘導能をもった細胞外miRNA
5　miR-199-3pの筋分化誘導
6　筋再生におけるmiR-199-3pの効果
7　老齢筋萎縮に対するmiR-199-3pの効果
8　miR-199-3pの筋疾患に対する治療効果
9　おわりに

第25章　老化とmicroRNA
1　細胞老化とは
2　細胞老化に関わる分子とマーカー
3　細胞老化を制御するmiRNA
4　老化制御機構を標的とした治療戦略について

<その他>

第26章　miRNA機能解析技術の進歩
1　miRNAの発現プロファイリング
2　バイオインフォマティクスアルゴリズムによるmiRNAターゲットの予測
3　細胞ベースのレポーターライブラリーアッセイを用いたmiRNAのターゲットスクリーニング
4　CLIPによるmiRNAとターゲットの相互作用

第27章　エクソソームと臓器連関
1　はじめに
2　Exo-miRNA放出器官としての脂肪組織
3　肥満におけるExo-miRNAを介した臓器連関
4　Exo-miRNAによる膵β細胞増殖
5　おわりに

第28章　RNA修飾と疾患
1　はじめに
2　N6-Methyl Adenosine(m6A)修飾酵素と疾患
　2.1　Methyltransferase-Like Protein 3(METTL3)
　2.2　Fat Mass And Obesity-Associated Protein(FTO)
　2.3　Alpha-Ketoglutarate-Dependent Dioxygenase AlkB Homolog 5(ALKBH5)
3　N7-Methyl Guanosine(m7G)修飾酵素と疾患
4　N1-Methyl Guanosine(m1G)修飾酵素と疾患
　4.1　tRNA Methyltransferase 10A(TRMT10A)
　4.2　tRNA Methyltransferase 10C(TRMT10C)
5　5-Methyl Cytosine(5mC)修飾酵素と疾患
　5.1　DNA(cytosine-5-)-Methyltransferase 2(DNMT2)
　5.2　NOP2/Sun RNA Methyltransferase 2(NSUN2)
6　N4-Acethyl Cytosine(ac4C)修飾酵素と疾患
7　Pseudo Uridine(ψ)修飾酵素と疾患
8　おわりに

【第Ⅱ編　miRNA検出・診断技術】

第1章　次世代シーケンサーによる細胞外miRNA測定
1　はじめに
2　細胞外解析サンプル
3　細胞外miRNA抽出及びクオリティーチェック
4　細胞外シーケンスライブラリー調整
5　細胞外miRNA-Seqのシーケンスデータ
6　おわりに

第2章　DNAチップによる血漿・血清中miRNA測定
1　はじめに
2　血中miRNAの測定技術の課題
3　血中miRNAの抽出精製技術
4　血中miRNAの測定技術
5　おわりに

第3章　ナノワイヤデバイスによる尿中miRNA測定
1　はじめに
2　リキッドバイオプシーの低侵襲性・簡便性
3　リキッドバイオプシーの網羅性
4　細胞外小胞
5　ナノワイヤの開発
6　ナノワイヤデバイスにより抽出した尿中miRNAの解析
7　ナノワイヤとAIによる尿中miRNA解析と脳腫瘍の早期検知
8　おわりに

第4章　ナノポアテクノロジーによるmiRNAおよびエクソソームの検出
1　はじめに
2　ナノポア技術を用いたmiRNAの直接検出
3　MinIONによるmiRNA検出
4　ナノポア技術によるエクソソームの検出
5　おわりに

第5章　ビーズ濃縮によるmiRNA定量技術
1　はじめに
2　バイオマーカーとしてのマイクロRNA
　2.1　マイクロRNAの分子生物学
　2.2　物理化学的性質をもとにした他バイオマーカーとの比較
3　測定技術基盤
4　まとめ

第6章　AIを用いたマイクロRNAと診断応用への実際と課題
1　はじめに
2　ゲノム分析からプロテオミックスなどを網羅的に分析するAIを用いたがん診断
3　深層学習の基本特徴
4　AIをがん診断に利用する際の問題点
5　実用化へ向けた転移学習の利用
6　深層学習による学習のプロトコールと実際